Водораздельный бьеф КиМ включает в себя несколько водохранилищ, участки рукотворного русла и естественные водотоки – подмосковные речки, заключенные в ограждающие насыпи, прорыв такой дамбы мог бы привести к катастрофическим последствиям для расположенных на его берегах населенных пунктов. Под каналом также проходят трубы, дюкеры и другие сооружения, которые могут нуждаться в ремонте. По этим причинам вся трасса канала была разделена на участки, в начале и конце которых установили заградительные ворота, позволяющие изолировать часть водного пути и с помощью насосов осушить его. Участок между Химкинским и Клязьминским водохранилищами, т.н. «Глубокая выемка» контролируется парой таких заградворот – с севера со стороны Долгопрудного №121 и южные №73 в городе Химки. С двух сторон русла выступают полукруглые бетонные устои, на восточном берегу стоят белые строения, оформленные как парковые павильоны эпохи классицизма – глухие арки, по углам сдвоенные колонны коринфского ордера, дентикулы на карнизе. Внутри них скрывается подъемный механизм, при необходимости за полчаса поднимающий фермы Томаса, в обычном состоянии лежащие на дне канала.